Podpis pięciu genów i wyniki kliniczne w niedrobnokomórkowym raku płuc czesc 4

Ta kohorta została wykorzystana do walidacji naszego modelu prognozowania ryzyka pięciu genów. Aby dodatkowo zweryfikować nasz model, zastosowaliśmy go do danych z mikromacierzy 86 pacjentów z NSCLC, zgłoszonych przez Beer i wsp. 10 (dostępne na stronie http://dot.ped.med.umich.edu:2000/ourimage/pub/Lung/ index.html). Pięć genów (i odpowiadające im zestawy sond Affymetrix) to DUSP6 (X93920_at), MMD (X85750_at), STAT1 (M97936_at), ERBB3 (S61953_at) i LCK (M26692_s_at); genem kontrolnym był TBP (X54993_s_at). Aby poziomy ekspresji genów z mikromacierzy i RT-PCR były porównywalne, przekształciliśmy logikę danych mikromacierzy na skalę podstawową 2 po przypisaniu wartości 1,1 do wartości intensywności poniżej 1,1. Read more „Podpis pięciu genów i wyniki kliniczne w niedrobnokomórkowym raku płuc czesc 4”

Podpis pięciu genów i wyniki kliniczne w niedrobnokomórkowym raku płuc cd

Geny ochronne zdefiniowano jako geny związane ze współczynnikiem ryzyka śmierci poniżej 1; geny ryzyka zdefiniowano jako związane ze współczynnikiem ryzyka śmierci powyżej 1). Zastosowaliśmy analizę jednowymiarowej Cox-proporcjonalnej analizy regresji w celu oceny związku między przeżyciem a poziomem ekspresji każdego genu z analizy mikromacierzy.25 Dla genów, które były znacząco skorelowane z przeżyciem, wykorzystaliśmy liniową kombinację wartości kodujących ekspresję genu, ważoną przez współczynniki regresji, aby obliczyć ocenę ryzyka dla każdego pacjenta.6,10 Podpis 16-genowy
Oceny ryzyka obliczono dla 16 genów. Wynik ryzyka pacjenta obliczono jako sumę poziomów ekspresji każdego genu, mierzoną za pomocą analizy mikromacierzy, pomnożoną przez odpowiednie współczynniki regresji (patrz sekcja Metody w dodatkowym dodatku). Pacjentów sklasyfikowano jako posiadających sygnaturę genu wysokiego ryzyka lub sygnaturę genu niskiego ryzyka, z 50. percentylem (medianą) wyniku ryzyka jako wartością progową (mediana, 4,9; zakres, 1,3 do 21,9). Read more „Podpis pięciu genów i wyniki kliniczne w niedrobnokomórkowym raku płuc cd”

Podpis pięciu genów i wyniki kliniczne w niedrobnokomórkowym raku płuc ad

Przebadaliśmy zamrożone próbki tkanki raka płuca od 125 losowo wybranych pacjentów, którzy przeszli chirurgiczną resekcję NSCLC w Szpitalu Weteranów Weterynarii w Taichung w okresie od grudnia 1999 do grudnia 2003. Spośród tych 125 próbek, 60 było gruczolakorakami, 52 były rakami płaskokomórkowymi, i 13 było innymi rodzajami raka. Dokonaliśmy walidacji modelu prognozowania ryzyka pięciu genów przy użyciu niezależnej kohorty 60 losowo wybranych pacjentów, którzy przeszli chirurgiczną resekcję NSCLC w Szpitalu Weteranów Weterynarii w Taichung w okresie od listopada 1999 r. Do grudnia 2003 r. Pacjenci nie otrzymywali chemioterapii uzupełniającej. Read more „Podpis pięciu genów i wyniki kliniczne w niedrobnokomórkowym raku płuc ad”

Podpis pięciu genów i wyniki kliniczne w niedrobnokomórkowym raku płuc

Obecne metody klasyfikacji są niewystarczające do przewidywania wyniku leczenia niedrobnokomórkowego raka płuca (NSCLC). Opracowaliśmy pięcio- genową sygnaturę, która jest ściśle związana z przeżyciem pacjentów z NSCLC. Metody
Wykorzystaliśmy generowane komputerowo liczby losowe do przypisania 185 zamrożonych próbek do analizy mikromacierzy, analizy łańcuchowej polimerazy z odwrotną transkryptazą (RT-PCR) w czasie rzeczywistym lub do obu. Badaliśmy ekspresję genową w zamrożonych próbkach tkanki raka płuca 125 losowo wybranych pacjentów, którzy przeszli chirurgiczną resekcję NSCLC i ocenili związek między poziomem ekspresji i przeżyciem. Wykorzystaliśmy ocenę ryzyka i analizę drzewa decyzyjnego, aby opracować model ekspresji genów do prognozowania wyniku leczenia NSCLC. Read more „Podpis pięciu genów i wyniki kliniczne w niedrobnokomórkowym raku płuc”

Zastawkowa choroba serca i stosowanie agonistów dopaminy w chorobie Parkinsona cd

Pacjenci z nadciśnieniem tętniczym byli rekrutowani do odtworzenia w grupie kontrolnej tej samej częstotliwości nadciśnienia, co w całej grupie pacjentów. Echokardiografia
Wszyscy zapisani pacjenci i osoby kontrolne przeszli kompletne badanie echokardiograficzne przezklatkowe. Wszystkie echokardiogramy zostały wykonane przy użyciu tego samego sprzętu (Acuson Sequoia, Siemens) przez dwóch doświadczonych echokardiografów, którzy nie byli świadomi stanu leczenia pacjentów; pacjenci i lekarze zostali poinstruowani, aby nie rozmawiać o historii leczenia pacjentów. Szczególną uwagę poświęcono badaniom morfologicznym zastawek mitralnych, aortalnych i trójdzielnych. Dane echokardiograficzne i dopplerowskie dla pacjentów i osób kontrolnych były przechowywane na dyskach optycznych do analizy off-line i były interpretowane niezależnie i w zaślepiony sposób przez dwóch ultrasonografów. Read more „Zastawkowa choroba serca i stosowanie agonistów dopaminy w chorobie Parkinsona cd”

Zastawkowa choroba serca i stosowanie agonistów dopaminy w chorobie Parkinsona ad

Nieprawidłowości te są również bardzo podobne do walwulopatii związanych z rakowiakami.10-13 Zaproponowano, że uszkodzenie zastawkowe wywołane przez te czynniki może być mediowane przez układ serotoninergiczny. Wykazano, że wszystkie zaangażowane leki mają wysokie powinowactwo i są pełnymi lub częściowymi agonistami podtypu 5-HT2B receptora serotoninowego (5-hydroksytryptaminy [5-HT]), który ulega ekspresji w zastawkach serca i jest znany pośredniczyć w mitogenezie.14,15 Proliferacja fibroblastów może zatem wystąpić w tkance zastawki, gdy receptor 5-HT2B jest stymulowany.
Aby ocenić częstość występowania choroby zastawkowej u pacjentów leczonych agonistami dopaminy pobranymi z sporyszu, wykonaliśmy echokardiografię w dużej reprezentatywnej próbce pacjentów z chorobą Parkinsona, którzy byli leczeni pergolidem, kabergoliną lub agonistami dopaminy niebędącymi sporyszem oraz w grupie osób kontrolnych bez choroby Parkinsona. Oceniliśmy stopień niedomykalności zastawek mitralnych, aortalnych i trójdzielnych, a także stopień deformacji aparatu zastawki mitralnej.
Metody
Przedmioty
Zrekrutowaliśmy wygodną próbkę pacjentów z dużej grupy pacjentów uczestniczących w ambulatoryjnym leczeniu Parkinson Institute w naszym szpitalu w Mediolanie. Read more „Zastawkowa choroba serca i stosowanie agonistów dopaminy w chorobie Parkinsona ad”

Zastawkowa choroba serca i stosowanie agonistów dopaminy w chorobie Parkinsona

Sponsorzy agoniści receptora dopaminy, często stosowani w leczeniu choroby Parkinsona, są związani ze zwiększonym ryzykiem wystąpienia wady zastawkowej serca. Metody
Przeprowadzono badanie prewalencji echokardiograficznej u 155 pacjentów przyjmujących agonistów dopaminy w chorobie Parkinsona (pergolid, 64 pacjentów, 49 kabergoliny, 49 i agonistów dopaminy niebędących pochodnymi ergotaminy, 42) i 90 osób kontrolnych. Zwężenie zastawki zostało ocenione zgodnie z zaleceniami American Society of Echocardiography. Obszar mierzenia zastawki mitralnej był również mierzony i wykorzystywany jako wskaźnik ilościowy do usztywnienia listków i punktowego przemieszczenia przymocowania ulotki.
Wyniki
U pacjentów przyjmujących pergolid (23,4%) lub kabergolinę (28,6%) stwierdzono istotne znaczenie niedomykalności (umiarkowanej do ciężkiej, stopnia 3. Read more „Zastawkowa choroba serca i stosowanie agonistów dopaminy w chorobie Parkinsona”

Podpis pięciu genów i wyniki kliniczne w niedrobnokomórkowym raku płuc ad 7

Pozwala to na dokładną i powtarzalną kwantyfikację wyników dla RNA uzyskanego z niewielkich ilości próbek zatopionych w parafinie.17,31 Wyniki RT-PCR przeprowadzonego na 8 genach, wybranych z całkowitej liczby 45, okazały się ostatnio skorelowane z wyniki gruczolakoraka płuca.5 Zidentyfikowaliśmy opartą na RT-PCR pięcioso- genową sygnaturę (w tym DUSP6, MMD, STAT1, ERBB3 i LCK) wykorzystując ocenę ryzyka na podstawie analizy mikromacierzy i drzewa decyzyjnego 125 zamrożonych próbek nowotworów od pacjentów z NSCLC. Próbki podzielono losowo na zestaw treningowy (63 próbki) i zestaw testowy (62 próbki). Obecność pięciosegmentowej sygnatury wysokiego ryzyka w nowotworach NSCLC była związana ze zwiększonym ryzykiem nawrotów i zmniejszeniem przeżywalności ogólnej.
Nasza selekcja genów w zestawie treningowym na mikromacierzy została zwalidowana w zestawie do testowania mikromacierzy, a wzory ekspresji genów znalezione w analizie mikromacierzy zostały zwalidowane za pomocą RT-PCR. Nasze wyniki zostały również zatwierdzone w niezależnej kohorcie 60 pacjentów, którzy byli leczeni w Szpitalu Ogólnym Weteranów w Taichung. Read more „Podpis pięciu genów i wyniki kliniczne w niedrobnokomórkowym raku płuc ad 7”

Podpis pięciu genów i wyniki kliniczne w niedrobnokomórkowym raku płuc ad 6

Współczynniki zagrożenia dla śmierci z dowolnej przyczyny wśród pacjentów z NSCLC, według wieloczynnikowej analizy regresji Coxa. Zgodnie z wieloczynnikową analizą regresji Coxa, pięciosegmentowy podpis wysokiego ryzyka, III stopień zaawansowania guza i starszy wiek były istotnie związane ze śmiercią z jakiejkolwiek przyczyny wśród 101 pacjentów (tabela 3), a pięciosegmentowy podpis wysokiego ryzyka i stadium III nowotworu było istotnie związane również z nawrotem raka (współczynnik ryzyka dla sygnatury wysokiego ryzyka w porównaniu z sygnaturą niskiego ryzyka, 1,92, przedział ufności 95% [CI], 1,06 do 3,46, P = 0,03; stadium III vs. stadium I lub II choroby, 2,28; 95% CI, 1,33 do 3,91; P = 0,003). W analizie podgrupy 59 pacjentów z I lub II stadium zaawansowania, osoby z sygnaturą genu wysokiego ryzyka miały krótszy całkowity czas przeżycia i krótsze przeżycie bez nawrotów niż osoby z sygnaturą genu niskiego ryzyka (Ryc. 2C i 2D, odpowiednio ). Read more „Podpis pięciu genów i wyniki kliniczne w niedrobnokomórkowym raku płuc ad 6”

Multidrug-Resistant Salmonella enterica Serotyp Typhimurium związany z gryzoniami

Szacunkowo 1,4 miliona infekcji salmonellą występuje rocznie w Stanach Zjednoczonych. Większość z tych zakażeń jest przenoszona drogą pokarmową, ale wiele z nich nabywa się poprzez kontakt ze zwierzętami. W sierpniu 2004 r. Wyizolowano serotyp Typhimurium z Salmonella enterica, który był nie do odróżnienia od elektroforezy w żelu pulsującym (PFGE), z ośmiu chomików od dystrybutora zwierząt w Minnesocie. Przeprowadziliśmy dochodzenie, aby ustalić, czy ludzkie przypadki salmonelli mogą być powiązane z tym szczepem przenoszonym przez gryzonie. Read more „Multidrug-Resistant Salmonella enterica Serotyp Typhimurium związany z gryzoniami”